专项资金冻结需依法律规定进行。依据相关法律法规《民事诉讼法》等，冻结分自愿与强制两种。强制冻结涉及司法干预，拒不履行义务者，法院有权查封冻结财产。不及时处理可能导致资金长期无法动用，影响项目运营及财务健康。
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专项资金冻结分情况处理。自愿冻结：携带证件至银行办理。强制冻结：涉及纠纷时，向法院申请或法院依职权，需提供相关证据，法院审查后作出裁定，执行冻结。不及时处理，资金将被长期冻结，影响使用。
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专项资金冻结处理方式分自愿与强制。自愿冻结只需携带有效证件；强制冻结需通过公安司法途径，如涉及民事纠纷拒不履行义务，法院可依申请或职权采取。选择方式需根据具体情况及法律依据决定。