农村自建房一般土地都是宅基地，首先你要有宅基地审批手续，有宅基地审批手续后，又要有建设工程许可证等你才可以建房，建房的面积和建筑物占地面积不能超过许可证上的面积，因为有相关政策规定，在面积不超的情况下，如果你只盖一层，也是可以办房地一体合一的不动产权证书的。如果没有合法的用地手续和建房审批手续，不管盖几层，都无法办理到不动产权证书。