在经济纠纷中，仲裁协议具有关键作用。首先，它确定了双方争议解决的方式，即选择仲裁而非诉讼。根据《中华人民共和国仲裁法》第二条，平等主体间的合同纠纷和其他财产权益纠纷可通过仲裁解决。仲裁协议确保了仲裁机构有权受理案件，并排除了法院对这类案件的管辖权，使得争议能够在双方约定的仲裁机构内得到专业、高效的解决。
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经济纠纷中，自行协商处理的优势在于快速、灵活、成本低，有助于维护双方商业关系。但劣势也明显，如缺乏法律强制力，协商结果可能难以执行；双方立场差异大时，难以达成共识；且协商过程中可能泄露商业秘密。因此，在选择协商处理时需权衡利弊。
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如双方协商不成，可通过以下法律途径解决经济纠纷：1. 若存在仲裁协议，则依法向仲裁机构申请仲裁，仲裁机构将依据《仲裁法》进行裁决。2. 若无仲裁协议或仲裁协议无效，可向有管辖权的法院提起诉讼，法院将按照《民事诉讼法》的规定，先行调解或作出判决。若一方不履行判决，可申请法院强制执行。